學(xué)校現(xiàn)有國家一級重點學(xué)科1個，國家二級重點學(xué)科2個，國家重點（培育）學(xué)科2個；江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程二期項目立項學(xué)科2個、重點序列學(xué)科2個；江蘇省重點學(xué)科10個；國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥重點學(xué)科33個。臨床醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)與毒理學(xué)2個學(xué)科進(jìn)入ESI全球排名前1%。學(xué)校是全國首批具有碩士學(xué)位、博士學(xué)位授權(quán)的單位之一�，F(xiàn)擁有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合3個博士一級學(xué)位點，學(xué)位點覆蓋中醫(yī)、中藥、中西醫(yī)結(jié)合所有二級學(xué)科。

學(xué)校堅持以學(xué)生為中心，著力推進(jìn)9年本博一貫制和“5+3”一體化中醫(yī)拔尖人才培養(yǎng)模式改革，入選國家“卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃改革”首批試點高校�，F(xiàn)有卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃改革試點項目3個，國家級專業(yè)建設(shè)點5個，國家級專業(yè)綜合改革試點項目2個，國家級精品資源共享課程6門，國家級教學(xué)團隊2個，國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)1個，國家級虛擬仿真實驗教學(xué)中心1個，國家級實驗教學(xué)示范中心3個，國家級大學(xué)生校外實踐教育基地1個，國家級規(guī)劃教材（主編）33部，國家級教學(xué)成果4項。建設(shè)有南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院（江蘇省中醫(yī)院）、南京中醫(yī)藥大學(xué)第二附屬醫(yī)院（江蘇省第二中醫(yī)院）、南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬南京八一醫(yī)院（中國人民解放軍第八一醫(yī)院）等3家直屬附屬醫(yī)院、29所非直屬附屬醫(yī)院、4所中西醫(yī)結(jié)合臨床醫(yī)學(xué)院和3所附屬藥業(yè)，各類教學(xué)及畢業(yè)實基地逾百所。

學(xué)�？蒲袑嵙π酆�，現(xiàn)有國家發(fā)改委工程研究中心1個，教育部重點實驗室1個，教育部工程研究中心1個，江蘇省重點實驗室2個，江蘇省工程研究中心（工程實驗室）6個，江蘇省高校重點實驗室7個（含國家重點實驗室培育建設(shè)點1個），江蘇省海洋重點實驗室1個，江蘇高校哲學(xué)社會科學(xué)重點研究基地1個，國家中醫(yī)藥管理局重點研究室4個，國家技術(shù)轉(zhuǎn)移示范中心1個，是國務(wù)院和文化部首批命名的“全國古籍重點保護單位”，是中國中醫(yī)藥文獻(xiàn)信息檢索中心南京分中心。年來，學(xué)校科研工作成績顯著，先后獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步獎二等獎2項，2016、2017年度國家自然科學(xué)基金資助立項總數(shù)位居全國高校百強行列，項目經(jīng)費總額名列全國中醫(yī)藥院校前茅。學(xué)校主辦的《南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報》系中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫（CSCD)核心庫來源期刊，中文核心期刊，中國高校百佳科技期刊。

學(xué)校治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn)，學(xué)術(shù)氛圍濃厚，名家云集，人才輩出，是全國中醫(yī)師資進(jìn)修教育基地。擁有國醫(yī)大師6人，全國名中醫(yī)4人，雙聘院士2人，“”特聘教授2人，國家杰出青年科學(xué)基金獲得者6人，國務(wù)院學(xué)科評議組成員3人，國家“973計劃”項目首席科學(xué)家1人，百千萬工程國家級人選7人，國務(wù)院政府特殊津貼獲得者54人，國家有突出貢獻(xiàn)中青年專家2人，國家教學(xué)名師2人，全國模范教師1人，全國優(yōu)秀教師6人，中醫(yī)藥高等學(xué)校教學(xué)名師3人，國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金1人，江蘇省特聘教授10人，白求恩獎?wù)芦@得者2人，何梁何利基金科學(xué)與技術(shù)創(chuàng)新獎獲得者1人，形成了一支在全國中醫(yī)藥院校中領(lǐng)先的高水教師隊伍。

學(xué)校是世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓(xùn)中心，是國家教育部批準(zhǔn)接受和培養(yǎng)外國留學(xué)生及臺港澳地區(qū)學(xué)生的首批高等中醫(yī)藥院校之一。1993年學(xué)校與澳大利亞皇家墨爾本理工大學(xué)合作開辦中醫(yī)學(xué)專業(yè)，首開我國與西方正規(guī)大學(xué)合作開展中醫(yī)學(xué)歷教育先河。學(xué)校著力通過海外孔子學(xué)院和中醫(yī)藥中心，推動中醫(yī)藥海外傳播。2010年6月20日，學(xué)校與澳大利亞皇家墨爾本理工大學(xué)合作建立了中醫(yī)孔子學(xué)院，同志出席了揭牌儀式并發(fā)表重要講話。學(xué)校目前與世界90多個國家和地區(qū)有著廣泛交流和聯(lián)系，并與世界30多個國家和地區(qū)的政府、高等院�；�?qū)W術(shù)團體及機構(gòu)建立了友好合作關(guān)系，具有較高的國際聲譽和影響力，先后在大洋洲、歐洲、美洲建立了8個海外中醫(yī)藥中心，其中中國—澳大利亞、中國—瑞士、中國—法國3個中心成為國家級海外中醫(yī)藥中心。

在長期的辦學(xué)實踐中，學(xué)校秉承“自信、敬業(yè)”的校訓(xùn)、“團結(jié)奮進(jìn)、繼承創(chuàng)新”的校風(fēng)、“學(xué)貫中西，至精至誠”的辦學(xué)理念、“仁德、仁術(shù)、仁人”的教育理念，彰顯，追求卓越，各項事業(yè)快速發(fā)展，2012年在全國中醫(yī)院校中率先通過護理學(xué)專業(yè)認(rèn)證，2015年學(xué)校以優(yōu)異的成績順利通過本科教學(xué)工作審核評估和中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)專業(yè)認(rèn)證，2016、2017《中國大學(xué)評價》排名位居全國中醫(yī)藥院校之首。面向未來，學(xué)校將繼續(xù)深化體制機制改革，大力實施“人才強校、質(zhì)量興校”戰(zhàn)略，堅持發(fā)展，加強內(nèi)涵建設(shè)，積極創(chuàng)建高水、有、國際化的世界一流中醫(yī)藥大學(xué)。